α螺旋-转角-α螺旋基元详细资料大全
α螺旋-转角-α螺旋基元是最早在原核基因的激活蛋白和阻遏蛋白中发现的调控蛋白， 是一种同型二聚体 。
最后 ，螺旋-环-螺旋（Helix-loop-Helix ，HLH）基序由两个α螺旋和一个非螺旋环组成，如原癌基因产物C-myc及其结合蛋白Max 。在基因调控中 ，这些基序的组合使得蛋白质能够精确地识别并结合到特定的DNA序列上。
构成同型二聚体的每个单体由20个氨基酸的小肽组成α螺旋-转角-α螺旋结构 ，两个α螺旋相互连接构成β转角，其中羧基端的α螺旋为识别螺旋（recognition helix） ，负责识别DNA大沟的特异碱基信息 ，另一个α螺旋没有碱基特异性，与DNA磷酸戊糖链骨架接触 。
IKB-α的IKBs家族
1 、IKB蛋白家族成员有IKBα（MAD-3 ，pp40） 、IKBβ、IKBγ/p10IKBδ/p100 、IKBε 、Bcl-3以及果蝇属的Cactus等 。其家族结构特点是均有多个约33个氨基酸的重复序列 ，称为崐SWI6/锚蛋白重复序列，主要参与与Rel蛋白的RHD相互作用。
非组蛋白的结构模式
1、虽然非组蛋白种类众多，但是根据它们与DNA结合的结构域不同 ，可分为不同的家族 。α螺旋-转角-α螺旋模式（helix - turn - helix motif）这是最早在原核基因的激活蛋白和阻抑物中发现的 。迄今已经在百种以上原核细胞和真核生物中发现这种最简单 、最普遍的DNA结合蛋白的结构模式。
2 、首先 ，组蛋白是DNA结构中的主角，其家族成员包括H2A、H2B 、H3和H4 。这些蛋白质以八聚体的形式（H2A-H2B-H3-H4）紧密合作 ，加上Histone1 ，共同构成了DNA的“梳子 ”结构 。这种结构确保了DNA分子的紧密包装，每170个碱基对（bps）形成一次紧密拥抱 ，从而精确调控基因。然而 ，组蛋白并非孤军奋战。
3 、首先，让我们聚焦于组蛋白 ，它们是DNA舞台上不可或缺的主角 。组蛋白家族的成员包括H2A、H2B、H3和H4 ，它们以八聚体形式（H2A-H2B-H3-H4）紧密合作，加上Histone1 ，共同构建DNA的梳子结构 。这个神奇的组合并非随意为之 ，DNA分子大约以每170个碱基对（bps）的紧密拥抱，确保了基因的精确调控。
4 、非组蛋白大致包含下列三类蛋白质：①细胞核内大量的酶 。包括DNA合成及修复过程中的DNA多聚酶和连接酶，核糖核酸（RNA）聚合酶 ，以及核酸和蛋白质如组蛋白在修饰过程中所需要的酶；②在染色体中起结构作用的蛋白质；③其他尚未阐明功能的蛋白质 。
5 、非组蛋白与DNA相互作用的5种结构模式中 ，有一种叫“HMG框 ”，该结构由3个α螺旋组成 ，具有弯曲DNA的功能。DNA弯曲后 ，能与邻近位点结合的其他转录因子发生相互作用而激活转录，在此 ，HMG框相当起了构件因子的作用 。
6、HMGB1 ，即高迁移率族蛋白B1，作为真核细胞核内的非组蛋白 ，其在炎症反应上游发挥着关键调控作用 。这个高度保守的蛋白广泛存在于哺乳动物的细胞和组织中 ，因其在凝胶电泳中的特性而得名。
位点特异性重组的机制和原理
所谓位点特异性重组（site-specific recombination）中，DNA节段的相对位置发生了移动 ，从而得到不同的结果─DNA序列发生重排 。位点特异性重组不依赖于DNA顺序的同源性（虽然亦可有很短的同源序列） ，而依赖于能与某些酶相结合的DNA序列的存在 。
位点特异性重组并不依赖于DNA序列的同源性，即使存在非常短的同源序列，其关键在于特定的DNA序列能够与某些酶结合。这些酶具备催化DNA链断裂和重新连接的能力 ，从而驱动位点特异性重组的发生 。相比之下 ，同源重组中的DNA链断裂是随机的，这使得RecA等蛋白质能够识别暴露出来的序列 ，进而引发交叉重组 。
Cre重组酶 来源：于1981年从P1噬菌体中发现。 结构：是一种38 kDa的蛋白质 ，由4个亚基和2个域组成。 功能：能特异性识别loxP位点，并介导其间的序列重组或删除 。 loxP位点 来源：来源于噬菌体P1 。 构成：由34bp的DNA序列构成 ，包括两个13bp的反向重复序列和一个8bp的间隔区。
位点特异性重组并不依赖于DNA序列的同源性 ，而是依赖于特定的DNA序列与某些酶的结合能力 。这些酶，如催化DNA链断裂和连接的酶 ，驱动了这种特定的重组过程 。相比之下 ，同源重组中的DNA链断裂是随机的，这使得RecA等蛋白质能识别并启动交叉重组。
原噬菌体位于这两个新的att位点之间 ，原噬菌体左边的位点是attL ，由序列BOP组成，右边的是attR，由序列POB组成 。上述位点的差异说明 ，整合和切除反应所需要的序列对是不同的：整合要求识别attP和attB ，但切除要求对attL和attR进行识别 。因此位点特异性重组的方向性特征是由重组位点的特征所控制的。
在基因工程中，同源重组可以用来精确修改基因序列 ，而位点特异性重组则能实现更复杂的基因操作 ，如基因插入 、删除和重排 。在遗传学研究中，同源重组有助于理解基因的功能和相互作用 ，位点特异性重组则可以用于构建复杂的基因表达调控系统 。
螺旋—转角—螺旋详细资料大全
螺旋—转角—螺旋（helix-turn-helix）是最初在λ噬菌体的阻遏蛋白中发现的一种DNA结合结构域。在阻遏蛋白氨基端有5段 α 螺旋 ，每段螺旋之间折转成一定角度相连线，其中两段负责同DNA结合（图7—6） 。螺旋3由9个胺基酸组成 ，与前面的由7个胺基酸组成的 。螺旋2形成一个角度。
α螺旋-转角-α螺旋基元是最早在原核基因的激活蛋白和阻遏蛋白中发现的调控蛋白 ， 是一种同型二聚体。
在反式作用因子的DNA结合结构域中，存在几种关键的基序 ，这些基序在调控基因表达中起着重要作用 。首先 ，螺旋/转角/螺旋（HTH）基序由两段螺旋结构，其中一段负责DNA识别，常见于同源异形结构域 ，这类结构在胚胎发育和细胞分化过程中发挥着调控基因表达的关键作用 。
反式作用因子的DNA结合结构域主要包括螺旋-转角-螺旋结构 、碱性螺旋-环-螺旋结构和锌指结构。螺旋-转角-螺旋结构是一种常见的DNA结合蛋白结构域 ，它由两个α-螺旋和一个转角组成 。第一个α-螺旋负责识别并结合DNA的大沟，而第二个α-螺旋则与DNA的磷酸骨架发生作用 ，稳定蛋白质与DNA的相互作用 。
细菌转录调控的基本结构单元 ，如tetRTetR家族，具有独特的特征。它们通常包含两个关键结构域：一个是负责接收信号的区域 ，另一个则是与DNA相互作用的区域 。在原核生物的转录调控中 ，HTH（螺旋-转角-螺旋）结构是DNA结合模块的普遍形式，大约95%的转录因子都采用这种模式来定位和结合它们的靶DNA序列 。
α螺旋-转角-α螺旋模式（helix - turn - helix motif）这是最早在原核基因的激活蛋白和阻抑物中发现的。迄今已经在百种以上原核细胞和真核生物中发现这种最简单、最普遍的DNA结合蛋白的结构模式 。这种蛋白与DNA结合时 ，形成对称的同型二聚体（symmetric homodimer）结构模式 。
常见的限制性核酸内切酶有什么?具体的名字
第一型限制酶 例如：EcoB 、EcoK。同时具有修饰（modification）及识别切割（restriction）的作用；另有识别（recognize）DNA上特定碱基序列的能力 ，通常其切割位（cleavage site）距离识别位（recognition site）可达数千个碱基之远 。例如：EcoB 、EcoK 。
第一型限制酶，如EcoB和EcoK ，是一种独特的酶 ，它们既能识别特定的DNA序列（认知功能），又能在数千个碱基之外进行切割（修饰和切割作用）。这类酶对DNA的处理涉及到复杂的修饰过程。
【答案】：Ⅰ类限制性核酸内切酶、Ⅱ类限制性核酸内切酶和Ⅲ类限制性核酸内切酶3类 。Ⅱ类限制性核酸内切酶最适合基因工程，因为Ⅱ类限制性核酸内切酶只由一条肽链构成 ，仅需Mg2+ ，切割DNA特异性最强，且就在识别位点范围内切断DNA 。
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希望本篇文章《DNA识别（DNARecognition）（dna识别技术）（dna识别技术）DNA识别（DNARecognition）》能对你有所帮助！
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